Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zzef1Q5SSH7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zzef1Q5SSH7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zzef1Q5SSH7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zzef1Q5SSH7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zzef1Q5SSH7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zzef1Q5SSH7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms