Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85aQ5SP85 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms