Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp22Q5DU02 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms