Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eme2Q56A04 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Eme2Q56A04 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eme2Q56A04 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms