Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prune2Q52KR3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prune2Q52KR3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prune2Q52KR3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prune2Q52KR3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms