Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrig2Q52KR2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrig2Q52KR2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms