Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms