Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx49Q4FZF3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx49Q4FZF3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms