Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc110Q3V125 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms