Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp48Q3V0C5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms