Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc27Q3V036 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms