Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnpc3Q3UZ01 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms