Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaaf3Q3UYV8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms