Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd3l2Q3UXB0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms