Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms