Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3USZ8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3USZ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3USZ8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3USZ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q3USZ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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