Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm28047Q3US59 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28047Q3US59 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms