Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cog7Q3UM29 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms