Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin1rt1Q3ULQ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms