Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcgf5Q3UK78 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcgf5Q3UK78 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms