Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Greb1Q3UHK3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms