Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zswim8Q3UHH1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms