Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pitpnm3Q3UHE1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitpnm3Q3UHE1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms