Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnrc6cQ3UHC0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms