Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms