Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnft2Q3UF64 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms