Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trafd1Q3UDK1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms