Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf180Q3U827 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf180Q3U827 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf180Q3U827 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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