Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YrdcQ3U5F4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YrdcQ3U5F4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms