Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kdm4dQ3U2K5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kdm4dQ3U2K5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms