Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vars2Q3U2A8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vars2Q3U2A8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms