Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc9Q3U0M1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms