Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc28Q3TX51 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc28Q3TX51 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms