Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gdpd4Q3TT99 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd4Q3TT99 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms