Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRR0

Map9, Microtubule-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map9Q3TRR0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Map9Q3TRR0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Map9Q3TRR0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms