Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc4Q3TR08 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms