Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrc2cQ3TLH4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrc2cQ3TLH4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms