Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uri1Q3TLD5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uri1Q3TLD5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uri1Q3TLD5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms