Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fubp3Q3TIX6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fubp3Q3TIX6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fubp3Q3TIX6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms