Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RubcnlQ3TD16 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RubcnlQ3TD16 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms