Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccbe1Q3MI99 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccbe1Q3MI99 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms