Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Trpm1Q2TV84 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trpm1Q2TV84 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms