Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

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Length 5,193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ush2AQ2QI47 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Ush2AQ2QI47 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ush2AQ2QI47 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ush2AQ2QI47 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ush2AQ2QI47 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ush2AQ2QI47 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ush2AQ2QI47 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ush2AQ2QI47 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ush2AQ2QI47 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ush2AQ2QI47 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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