Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms