Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rpusd3Q14AI6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rpusd3Q14AI6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rpusd3Q14AI6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rpusd3Q14AI6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rpusd3Q14AI6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rpusd3Q14AI6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rpusd3Q14AI6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Rpusd3Q14AI6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rpusd3Q14AI6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Rpusd3Q14AI6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rpusd3Q14AI6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rpusd3Q14AI6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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