Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prok1Q14A28 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prok1Q14A28 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms