Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Perm1Q149B8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Perm1Q149B8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms