Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cpne7Q0VE82 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms