Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam83bQ0VBM2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam83bQ0VBM2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam83bQ0VBM2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms