Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hif3aQ0VBL6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms